你可能遇到了实验室核酸污染问题。
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实验室污染及影响
实时荧光PCR技术目前被广泛运用于疾病的实验室诊断、筛查等多个方面。长期的PCR实验,造成目标DNA片段大量累积、合成,不可避免地给实验室环境带来核酸污染,由于核酸不会自动降解,因此会在实验室环境内不断积聚。
由于实时荧光PCR技术灵敏度很高,即使少量的目标核酸片段污染,也会被检测出来,从而出现阳性结果,造成实验室检测与临床一线情况不符。
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常见的核酸污染消除方式
PCR检测实验室在运行中,需要预防和消除以往实验残留的阳性核酸。
实验室紫外照射对祛除核酸污染并不理想,不仅对照射距离和时间有要求,也仅对500bp以上长片段有效,对短片段效果不大,而实时荧光PCR的扩增片段一般在200bp以内。
实验室常用的核酸清除剂多为化学试剂,例如84消毒液等含氯消毒剂,其虽然对核酸祛除的效果明 显,但味道刺鼻,对实验人员不友好,而且对金属有腐蚀性,不能处理PCR仪器、移液器、核酸提取仪、离心机等精密仪器,会影响仪器寿命及精密度。下图1、2为某实验室长期使用带腐蚀性的消毒剂,导致设备出现锈蚀和故障的。
图1:生物安全柜长期使用含氯消毒剂进行消毒,导致内部生锈
图2:实验员错误的使用含氯消毒剂对PCR仪内部孔位进行消毒,导致PCR仪损坏
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有没有更好的去除核酸污染的方法
国测生物经过研发,推出新一代酶解型核酸清除剂:表清。
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表清®消除核酸的原理
表清采用全能核酸酶,快速与单链、双链、线状、环状、天然或变性等各种形式的DNA或RNA进行反应,将其降解为3至5个碱基长度的5'-单磷酸寡核苷酸。
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表清®的产品优点
1、无毒无害、无色无味:
表清是一款酶解型无毒害、无腐蚀、无刺激的核酸清除剂,适用于玻璃、塑料、陶瓷、橡胶、钢材和金属等多种材质,成分对人员友好。
2、作用迅速、耐受性强:
表清主要成分为全能核酸酶,在工作状态下,5min即可有效降解2μg的质粒DNA
3、半衰期短、不易残留:
表清混匀后使用,在室温下将会自然失活,不易残留。
4、操作简单、轻松使用:
表清混匀后直接喷洒在固相表面,或打湿一次性抹布/纱布后再擦拭精密仪器的固相表面,过5-10分钟后,可用干净抹布或纸巾擦拭
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表清®核酸清除验证实验
6.1、荧光定量方法验证:
将阳性质粒,分别与纯水、表清按200μL:200μL的模式混合,反应10min后,各组取200μL提取核酸,与阳性质粒一起进行检测,结果如下图3所示:原始的阳性质粒Ct值为22.39,纯水反应组的Ct值为22.78,表清反应组没有Ct值,说明10min内,表清已经完全将阳性质粒降解掉。
图3:表清降解阳性质粒效果图
6.2 琼脂糖凝胶方法验证
取5μLPCR扩增产物,分别与5μL核酸清除剂、5μL纯水混合,反应10min,立即进行凝胶电泳,结果如图4所示,反应组1已经看不到明显的扩增片段,而对照组2能看到明显的600bp大小条带。
图4:表清降解PCR扩增产物效果图
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表清®现场使用展示
图5:对实验室环境进行喷雾处理
图6:一次性纱布蘸取适量表清对离心机表面进行擦拭处理
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